Venkata R. Duvvuri

Scientifique, apprentissage machine
Laboratoire de santé publique Ontario

Une silhouette masculine sans détail.
DE L’IMPORTANCE DE SANTÉ PUBLIQUE ONTARIO

« Santé publique Ontario est un milieu de travail unique, où se retrouvent des spécialistes de la recherche, des politiques et de la pratique pour protéger et promouvoir la santé de la population ontarienne. À Santé publique Ontario, j’ai accès à une myriade de jeux de données qui m’aident à atteindre mon but : améliorer la santé de la population en résolvant des problèmes de santé publique complexes. »

Domaines d’expertise

  • science des données et apprentissage machine
  • épidémiologie génomique
  • microbiologie en santé publique
  • approche « Un monde, une santé »
  • données administratives sur la santé et données du dossier de santé électronique (DSE)

Nominations

Professeur adjoint, Département de médecine de laboratoire et de pathobiologie, Université de Toronto (imminente)

Diplômes et agréments

  • Programme d’études supérieures en intelligence artificielle et apprentissage machine : Analytique d’affaires, École de commerce McCombs, Université du Texas à Austin
  • Maîtrise en santé publique, École de santé publique et des systèmes de santé, Université de Waterloo
  • Maîtrise en sciences (biologie), Faculté des sciences, Université York
  • Doctorat en zoologie, Université Osmania

Intérêts de recherche liés à SPO :

  • Intégrer la science des données et l’apprentissage machine dans la microbiologie et la génomique en santé publique pour modéliser la découverte, l’évaluation et la prédiction des risques.
  • Élaborer des approches et des méthodes combinant la génomique et l’épidémiologie pour l’étude de la transmission des pathogènes et de la dynamique épidémique.
  • Identifier des biomarqueurs génomiques dans le génome des pathogènes pour créer des tests diagnostiques moléculaires et des vaccins candidats novateurs et rapides au moyen de l’immunoinformatique.
  • Accélérer la surveillance et la planification en santé publique au moyen de stratégies de santé publique et de soins de santé.

Activités de recherche actuelles liées à SPO

  • Élaborer un modèle génomique d’apprentissage machine pour étudier les problèmes de résistance aux antimicrobiens (RAM) en santé publique.
  • Étudier la dynamique évolutive et la dynamique de transmission de pathogènes viraux (comme le virus de la COVID-19 ou le virus respiratoire syncytial [VRS]), bactériens et fongiques au moyen de la phylodynamique.
  • Collaborer à la mise au point de méthodes diagnostiques originales et rapides pour les maladies infectieuses au moyen de l’immunoinformatique.
  • Fournir son expertise sur les protocoles de la science des données et les méthodes d’apprentissage machine.

Principales publications

  1. Lee JW, Su Y, Baloni P, Chen D, Pavlovitch-Bedzyk AJ, Yuan D, Duvvuri VR, et al. « Integrated analysis of plasma and single immune cells uncovers metabolic changes in individuals with COVID-19 ». Nat Biotechnol. 2022;40(1):110-20.
  2. Su Y, Chen D, Yuan D, Lausted C, Choi J, Dai CL, Voillet V, Duvvuri VR, et al. « Multi-omics resolves a sharp disease-state shift between mild and moderate COVID-19 ». Cell. 2020;183(6):1479-95.e20.
  3. Hicks JT, Lee D-H, Duvvuri VR, Kim Torchetti M, Swayne DE, Bahl J. « Agricultural and geographic factors shaped the North American 2015 highly pathogenic avian influenza H5N2 outbreak. PLoS Pathog. 2020;16(1):e1007857.
  4. Duvvuri VR, Deng X, Teatero S, Memari N, Athey T, Fittipaldi N, et al. Population structure and drug resistance patterns of emerging non-PCV-13 Streptococcus pneumoniae serotypes 22F, 15A, and 8 isolated from adults in Ontario, Canada ». Infect Genet Evol. 2016;42:1-8.
  5. Duvvuri VR, Granados A, Rosenfeld P, Bahl J, Eshaghi A, Gubbay JB. « Genetic diversity and evolutionary insights of respiratory syncytial virus A ON1 genotype: global and local transmission dynamics ». Sci Rep. 2015;5:14268.

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Publié le 31 mars 2022